Након што је у новембру 1805. Стигао до Тихог океана, корпус је основао Форт Цлатсоп, близу данашње Асторије, Орегон, као зимске четврти. Затим су се, 23. марта 1806., уморни истраживачи упутили кући и Сент Луис. Довели су своје коње од Индијанаца Нез Перце и прешли планине Биттерроот. Експедиција се одвојила на две стране у близини данашњег Лола у Идаху како би детаљније истражила земљу приликом повратка; групе би биле одвојене више од месец дана. За то време, Левисову компанију напали су ратници Блацкфоот, од којих су два погинула у борбама, само је крвопролиће експедиције. Убрзо након тога, полу-слепи приватник Пиерре Црузатте замијетио је Левиса за лакта и упуцао га у бедро. У време када се Левис поновно спојио са Кларком, нога му је скоро преполовљена. Стигавши у Ст. Лоуис 23. септембра 1806., Цларк је приметио: „Срели су нас по свим селима и добили смо жустру добродошлицу“. Пут корпуса на 8.000 миља је завршен.
Сгт. Јохн Ордваи
Наредник Ордваи, један од оригиналних чланова корпуса, помогао је у организацији првог зимског кампа у близини Сент Лоуиса. Попут осталих наредника, Ордваи је водио дневник, али он је једини снимао дневне уносе. 21. септембра 1806., када је корпус стигао до Светог Карла (у данашњој Мисури), Ордвеј је написао: „Вечерас смо стигли у Сент Карл испалили три круга и камповали на доњем крају града. Град се окупио на обали и тешко је могао веровати да смо то били они јер су чули и веровали да смо сви мртви и заборављени. "
Те јесени Ордваи је такође пратио Левиса и делегацију Мандана и Осаге Индијанаца у Васхингтон, ДЦ, како би разговарали о будућој америчкој трговини са тим племенима. Касније је свој часопис продао Левису и Цларку за 300 долара и преселио се у територију Мисури, где се оженио и почео да се бави земљом у близини Новог Мадрида. У децембру 1811. подручје су погодиле три велика земљотреса; погинуло између 500 и 1.000 људи. У време када је потрес погодио пети земљотрес, 7. фебруара 1812., једва да је кућа остала да стоји, а Нови Мадрид је постао град духова. О Ордваиу се мало тога зна након овога; учењаци претпостављају да би му земљотрес могао бити бескористан од земљотреса и да је умро у сиромаштву.
Капетан Мериветхер Левис
23. септембра 1806. године Левис је написао председнику Јефферсону: "Са задовољством вам обећавам сигуран долазак себе и странке .... У складу са вашим наређењима, пенитирали смо континент Северна Америка до Тихог океана. и довољно истражили унутрашњост земље да са поуздањем потврдимо да смо открили најпримјеренију руту која доза постоји широм континента помоћу пловних огранака ријека Миссоури и Цолумбиа. "
И Левис и Цларк били су великодушно награђени за своје услуге, а свака је добила велике парцеле земље и двоструку плату. Председник Јефферсон именовао је Левиса за гувернера територије Горње Луизијане у марту 1807; необјашњиво, Левис је чекао годину дана пре одласка у Ст. Лоуис како би преузео своје нове дужности. Једном тамо се задужио купујући земљу и припремајући експедицијске часописе за објављивање. Председник Јамес Мадисон, који је наследио Јефферсона, одбио је да му надокнади трошак новца који је тражио да врати делегацију Мандан и Осаге у њихову домовину, а ратни секретар Виллиам Еустис наговештавао је да ће Левис профитирати од ових средстава. У августу 1809., Узнемирени Левис написао је Еустису: "Никада нисам примио ни један новчани новац .... Обавештен сам да су против мене подигнута представништва - све бих волео да истрага буде потпуна и праведна." Крајем 1809. године Левис је напустио Ст. Лоуис за Васхингтон, ДЦ, како би избрисао своје име. Снажно депресиван, Левис је покушао самоубиство два пута успут. Након што је 10. октобра стигао до куће за путеве у Тенесију, 35-годишњи истраживач окончао је живот пуцајући у два пиштоља.
Јамес Неелли, индијски агент нације Цхицкасав, одмах је написао Тхомасу Јефферсону: "Са изузетном боли морам да вас обавестим о смрти Његове екселенције Мериветхер Левис, гувернера горње Лоуисиане, који је умро ујутро 11. тренутка и жао ми је што кажем самоубиство .... [Имао сам га као пристојно сахрањен колико сам могао на том месту - ако било шта жели да његови пријатељи ураде на његовом гробу, ја ћу присуствовати њиховим упутствима. "
Након Левисове смрти, администрација Медисона пристала је да плати остатак спорних рачуна.
Капетан Виллиам Цларк
Иако Цларк није добио капетанску комисију коју је Левис препоручио, Цларк је добио два именовања: бригадног генерала милиције и надређеног за послове Индије за горњу Луизијану. 1813. постављен је за гувернера територије у Мисурију, дужност коју је обављао до 1820. Након Левисове смрти, часописи за експедицију су послани Цларку, који их је предао уреднику Ницхоласу Биддлеу. Дневници су представљени јавности 1814. године, десет година након што је корпус започео епско путовање; њихово објављивање изазвало је мало помутње.
Цларков биограф Ландон И. Јонес напомиње: "30 година након експедиције Виллиам Цларк се сврстао у водећег савезног званичника на Западу, човека шесторице председника, од Јефферсона до Ван Бурена, који му је поверовао да штити америчке интересе на територији оштро оспоравају и Британија и Шпанија. " Цларк је утјеловио контрадикције свог времена; док је апелирао на владу да према Индијанцима поступа поштено, уговори које је прекршио присилно су се преселили у десетине хиљада. Цларк је умро у 68. години, 1838. године, у кући у Саинт Лоуису свог прворођеног сина, Мериветхер Левис Цларк.
Сацагавеа
Седам година након поновног окупљања са Схосхоне-ом, Сацагавеа и њен супруг су се појавили у Форт Мануелу, трговачком месту близу данашњег Бисмарка у Северној Дакоти, где је Тоуссаинт нашао посао као преводилац са компанијом Миссоури Фур. Новинар Хенри Брацкенридге написао је да је Сацагавеа болесна "и чезнула је да поново посети своју родну земљу". Никад није добила прилику. 20. децембра 1812. године, Јохн Луттиг, главни чиновник тврђаве, записао је у свој дневник да је Сацагавеа „умрла од грозне грознице. Била је добра и најбоља жена у тврђави“. Имала би око 25 година. Иза себе је оставила двоје биолошке деце: седмогодишњег Жана Баптистеа и четверомјесечну Лисетте.
Следеће године је Луттиг, вероватно заступајући Вилијама Кларка (за кога је радио), поднео молбу пред Судом сирочади у Сент Лоуису због старатељства над Јеан Баптисте-ом и Лисетте. (До тада, Тоуссаинт се претпостављао мртав, пошто га нису видели шест месеци.) Луттигово име је на крају прекрижено петицијом и замењено оним Цларк, који је, у најмању руку, платио Баптистеово образовање. (Баптисте је касније отпутовао у Европу, где је остао шест година. По повратку у Сједињене Државе, радио је као трапер код Јима Бридгера и Кит Царсон-а.) Лисетте-ова судбина, а нећака Сацагавеа, није позната.
Јеан Баптисте
Током експедиције, Вилијам Кларк је веома обожавао бебу Сацагавеа, постао његов скрбник и касније финансирао своје образовање у интернату у Ст. Лоуису.
Познате чињенице о животу Баптисте су малобројне. 1823. војвода Паул Вилхелм Фриедрицх Херзог из Вурттемберга у Немачкој посетио је трговачко место у данашњем граду Кансас, где је упознао тада 18-годишњака, који је радио као водич и преводилац. Њих двоје су путовали у Европу, где је Баптисте остао шест година. Родио је дете са Њемицом, али беба, дечак, умрла је после три месеца, а Баптисте се вратио у Сједињене Државе. Кренуо је према Западу, на крају радећи као трапер с Јимом Бридгером и Китом Царсоном.
Баптисте се настанио у Калифорнији, служећи као алкалде или судија у мисији Сан Луис Реи. 1866. придружио се истраживачима злата крећући се ка територији Монтане. На путу је развио пнеумонију и умро је недуго затим, у доби од 61 године, у Орегону близу границе са Идахом, наџививши све чланове експедиције, осим Сгт. Патрицк Гасс.
Иорк
Након завршетка експедиције, Цларк је 1807. отпутовао у Ст. Лоуис како би преузео дужност главног индијског агента за подручје Горње Лоуисиане и повео Иорк са собом. Раскопи су се развили између двојице мушкараца: Иорк је желео да остане у Кентуцкију, у близини његове супруге, коју није видео скоро пет година. Такође је замолио Цларка за своју слободу - можда мислећи на двоструку плату и 320 ари који су остали мушкарци добили за своје услуге у експедицији. Ови захтеви су погодили Цларка као самозадовољног који долази од роба. Цларк је на крају допустио Иорку да се врати у Кентуцки 1808. године на краћу посету. Али Цларк је написао свом брату Јонатхану: "Ако јорк покуша да побегне или одбије да изврши своју дужност робова, желим га послати у Нев Орлеанс и продан, или га ангажујем код неког озбиљног мајстора све док он не помисли боље од таквог понашања. "
У писму (сада у Јонатхан Цларк Паперс — Темпле Бодлеи Цоллецтион из Филсон Хисторицал Социети-а у Лоуисвилле-у) свом брату од неколико месеци касније, Цларк је написао: „Желео сам да му урадим добро - али како је и он добио такве предоџба о слободи и његовим службама, да не очекујем да ће ми поново пружити велику услугу; не мислим да ће с њим бити тако сјајна услуга (или би моја ситуација могла да ме ослободи). "
Иорк се вратио у Ст. Лоуис почетком 1809., Али Цларк га је и даље неповољно гледао. "Он је овде, али мени не пружа велику услугу", Кларк је написао Џонатану. "[Иорк је безобразан и Сулки. Ја сам му озбиљно мучио други дан и он је много поправио Сенце."
Последње помињање Јорка у писмима Вилијама Кларка појављује се у августу 1809; Кларк је био толико незадовољан са њим да је одлучио да га ангажује или прода. Јохн О'Фаллон, Цларков нећак, написао је 1811. године: "Термин за који је [Иорк] ангажован за господина Иоунг јуче је истекао, али верујем да је прихватљиво затражити да га је господин Фитзхугх поново ангажовао код господина Митцхела који живи око седам миља од овог места .... Претпостављам да је равнодушно био обучен ако га уопште има Иоунг .... "О'Фаллон даље примећује да се Јоркина супруга преселила са својим господаром и остатком домаћинства у Миссиссиппи; мало је вероватно да су се Иорк и његова супруга поново видели. Десет година након завршетка експедиције, Иорк је и даље поробљен, радећи као вагон за породицу Цларк.
1832. године писац Васхингтон Ирвинг интервјуисао је Цларка и питао се за Иоркову судбину. Цларк је одговорио да је коначно ослободио Иорк и рекао, зачуђујуће, да његов бивши роб није задовољан његовом слободом и покушао је да се врати у Цларк - умирући од колере на путу.
Али је ли? 1832. године, трговац крзном Зенас Леонард, обилазећи село Вране у северном централном делу државе Виоминг, „пронашао је црнца, који нас је обавестио да је у ову земљу први пут дошао са Левисом и Цларком - са којима се такође вратио у државу Мисури, и после неколико година поново се вратио са господином Мацкиннеијем, трговцем на реци Мисури, и остао је ту од тада - што је око десет или дванаест година. "
17. јануара 2001., председник Клинтон посмртно је унапређен Иорк у чин почасног наредника, редовне војске.
