Индонезија је превиђено родно место професионалне палеоантропологије. У Европи средином 19. века научници су први пут открили изумрлу хоминидну врсту: неандерталце. Заправо, тачније је рећи да су неандерталске фосиле пронашли лаици који су их потом привели пажњи познатих анатомиста. Тек 1890. године, истраживач је кренуо у поље у потрази за костима хоминида. Еугене Дубоис, холандски лекар, отпутовао је у Индонезију, тада холандску колонију, у потрази за људским прецима. Године 1891. открио је фосиле Хомо ерецтус и учинио лов на хоминиде исправним подухватом - а Азију је учинио дестинацијом за палеоантропологе.
Тринил: Дубоисова открића догодила су се близу села Тринил у централној Јави. Његово прво откриће био је лубањарски капак, за који је познато да је пре 700 000 до милион година. Лобања је изгледала људско, али имала је дебеле кости, тешке обрве и ниско косо чело. Годину дана касније, 1892., Дубоис је опоравио готово комплетну бутну кост која је изгледала готово модерно. Одлучио је да кости припадају изумрлој врсти која је била "нестала веза" мајмуна и људи. Назвао је врсту Питхецантхропус ерецтус („човек усправних мајмуна“). Некада се назива Јава човек, а данас се врста назива Хомо ерецтус .
Нгандонг: Холандски истраживачи открили су више фосила Х. ерецтус, који представљају 15 јединки, на Јави 1930-их у близини села Нгандонг на Јаваиној реци Соло. Донедавно су палеоантрополози сматрали да кости Нгандонг представљају врло рецентну популацију Х. ерецтус . Мислили су да су стари тек 30.000 до 50.000 година, ови хоминиди су могли бити савремени неандерталци и модерни људи који живе у Европи и западној Азији. Али новија анализа теренског рада и упознавања сугерира да су хоминиди Нгандонг-а живели много раније, негде између 143 000 и 546 000 година.
Мојокерто: 1936. године, асистент који је радио са Холандским геолошким заводом открио је делимичну лубању дво- до трогодишњег детета у источној Јави. Члан тима Ралпх вон Коенигсвалд, немачки палеонтолог, признао је да лобања припада раном хоминиду, Х. ерецтус . Иако се тачна локација фосила, а самим тим и старост, доводе у питање последњих година, научници углавном мисле да лобања Мојокерто датира пре око 1, 8 милиона година. Због тога је то једна од најстаријих костију хоминида икада пронађена ван Африке.
Сангиран: Између 1937. и 1941., вон Коенигсвалд је на локалитету Сангирана у централној Јави пронашао додатне фосиле Х. ерецтус . Налази су укључивали три делимичне лобање, делимичне чељусти и десетине изолованих зуба. Ови фосили, датирани пре више од милион година, помогли су да се потврди ваљаност статуса врсте Х. ерецтус . Данас туристи могу да посете фосилну локацију која је дом текућих ископавања као и музеј.
Флорес: Најновије откриће хоминида у Индонезији било је велико шокирање. 2004. године, група истраживача из Индонезије и Аустралије објавила је да су пронашли необичну колекцију фосила на индонезијском острву Флорес. Кости су припадале хоминиду малог мозга који је стајао мање од четири метра и тежио је мање од 70 килограма - а ипак, неки од фосила били су стари тек 17.000 година. Истраживачи су закључили да "Хобит" припада новој врсти, Хомо флоресиенсис . Једном када је предак врсте, можда Х. ерецтус, стигао на острво, хоминид се развио да би био мањи као прилагођавање животу на малом острву. Критичари, међутим, кажу да је Хобит у ствари модеран човек с некаквим поремећајем раста.
