https://frosthead.com

Пробијање ДНК кода

Експедицијски тим није очекивао да ће вода бити тако висока нити је задњи део планиране руте преко уског канала непроходан. Научници морају да се пребаце кроз сирови мост срушених грана да би стигли до врха југоистока острва и започели са прикупљањем узорака.

Сличан садржај

  • Скривени свет мрава

"У суштини, стојимо у тропској шуми", каже ботаничар Јохн Кресс. У мутној врућини, засукао је рукаве своје беле кошуље. Зграби малу гранчицу дрвећа и приближи јој бордо цвеће. „Осећам се као да сам у Костарики“, каже он.

Из шуме извире високи звиждук. Крессов колега, ботаничар Даве Ерицксон, у шали се пита да ли је то мајмун за завијање, који живи у Централној и Јужној Америци.

"То је све што желите да буде", каже Кресс.

Острво Плуммерс, копно величине 12 хектара у реци Потомац - само нешто више од десет миља од Крессове канцеларије у Националном музеју природне историје Смитхсониан - приближно је нетакнуто и мало вероватно, пејзаж какав се може наћи у унутрашњости Васхингтон, ДЦ Белтваи. Власници Националне парковне службе од 1961. године, Плуммерс је уједно и најпосећеније острво у Северној Америци. Захваљујући Крессу и његовим колегама, то је прво налазиште на свету са свих 250 биљних врста.

ДНК баркодирање, деца канадског генетичара Паула Хеберта, направљено је по узору на Универзални код производа (УПЦ) који се налази на амбалажи потрошача. Сваки УПЦ има број који означава произвођача (рецимо, компанија безалкохолних пића) и специфичан идентификатор производа (дијета, без кофеина итд.). Хеберт је пронашао сегмент животињске ДНК заједнички свим врстама (производни код) и довољно разнолик да разликује животињске врсте (идентификатор производа). Али истраживачима је било теже да пронађу стандардизовани ДНК сегмент за живот биљака.

Почевши од пре пет година, Крессов истраживачки тим прикупио је узорке сваке биљне врсте на острву Плуммерс. Затим су у лабораторији за ботанику Ерицксон и други одредили ДНК секвенцу. Одатле су се смјестиле у три генетске зоне - два гена и „интергенични размик“ између гена - који би колективно могли разликовати биљке. Заједно с осталим ботаничарима, Кресс и Ерицксон су усред формалног поступка за добијање маркера као стандардног биљног кода. Кресс се нада званичном прихватању за годину дана од Конзорцијума за Бар код живота, пројекта основаног 2004. године за сакупљање референтне библиотеке кодова.

Донедавно су таксономисти требали цвеће или плодове биљке да би их класификовали, што значи да су морали да прикупљају узорке у одређено доба године. Али помоћу ДНК баркодирања, они могу да користе било који део биљке - семе, кора, корење или лишће - да га идентификују.

„Али највећа корист је што нећете морати да будете експерт“, каже Кресс. У не тако далекој будућности, чак ће и школарци моћи да идентификују биљке помоћу ручних секвенцера ДНК. Затим су могли да пренесу баркодове помоћу паметних телефона у интернетску енциклопедију са основама о врстама, ботаничкој уметности и анегдотским информацијама. Управа за храну и лекове могла би да користи баркод за тестирање биљних додатака; Царина и заштита границе САД-а могле би да га користе за идентификовање сумњивог увоза.

Ерицксон је такође пронашао биљну ДНК у приземним цревима десет различитих реда инсеката са острва Плуммерс. Жели да боље разуме који су инсекти специјалисти, што значи да једу одређене биљне врсте, а који генералисти, који једу готово све.

"Ја их проналазим и мељем као типа", каже Ерицксон, претварајући уобичајену ботаничку кашу у похвалу. Кресс, вегетаријанац, преврће очима у заношеном гађењу.

"Дефинитивно нисте специјалиста", задиркује Ерицксон, убацујући јарко зелену гусјеницу у сићушну кесу примерка. "Ви сте генералиста. Видео сам да једете."

Ботаничари Јохн Кресс и Даве Ерицксон провели су пет година скупљајући и баркодирајући секвенце ДНК-а од 250 биљних врста на острву Плуммерс. (Степхен Восс) "Сада је за расе", ботаничар Даве Ерицксон каже о пројекту за баркод на 250 врста биљног живота на острву Плуммерс. (Степхен Восс) ДНК баркодирање се моделира након што се на амбалажи потрошача нађе Универзални код производа (УПЦ). (Степхен Восс)
Пробијање ДНК кода