Већина људи је чула за пројекат Људски геном - масивни научни пројекат секвенцирања људске ДНК који је кулминирао 2001. објављивањем првог људског генетског кода. Али да ли сте чули за атлас људских ћелија?
Напор укључује више од 480 научника који раде на 185 пројеката како би каталогизирали процијењених 37, 2 билиона ћелија у људском тијелу секвенцирањем најмање 10 милијарди ћелија из свих ткива, органа и система. Проучавајући генетику сваке ћелије, истраживачи се надају да ће боље разумети шта их чини крпељима.
Овај вишегодишњи напор је већ у току. Како јавља Кристен В. Бровн из Гизмодо- а, истраживачи су недавно објавили прву велику групу података, која детаљно описује 530 000 ћелија из имуног система.
Саставили су га истраживачи са МИТ-овог широког института, информације потичу из крви из пупчане врпце и ћелија коштане сржи одраслих особа. Секвенција хиљада појединих ћелија, међутим, није лак задатак. Према саопштењу за штампу, истраживачи су користили нове рачунске методе да брзо идентификују типове ћелија у подацима о секвенцирању као и да идентификују генетски отисак прстију за различите ћелије. Они су такође проучавали ћелијски развој.
Ти нови алати омогућили су научницима да се изборе са 224.000 ћелија коштане сржи прикупљених од четири одрасла пацијента - око 100 пута више ћелија од већине експеримената у секвенцији ћелија. Тим је секвенционирао сличан број ћелија из пупчане киле.
"Прикупљање и обрада пола милиона имуних ћелија био је херкулејски подвиг, који је укључивао чврсто координиран тимски рад у многим областима експертизе", каже у издању чланица тима широког института Даниелле Дионне.
Ово последње саопштење података придружује се два претходна скупа из Атласа хуманих ћелија: узорак од 2.000 ћелија из људске слезене и 6.639 ћелија из лимфног чвора миша. Овај нови скуп података од пола милиона ћелија је већи и ускоро ће бити помрачен другим подацима од 1, 08 милиона пупчане врпце, коштане сржи и белим крвним ћелијама које ће Широки институт ускоро објавити. Још 250.000 ћелија људског развоја такође је секвенцирано од стране Атласовог сарадника, али још увек нису објављене.
Све у свему, подаци су солидан први корак ка анализи 10 милијарди ћелија. Почетни циљ Конзорцијума је да произведе први нацрт Атласа који садржи 30 до 100 милиона ћелија.
Као што Стеве Цоннор из МИТ Тецхнологи Ревиев објашњава, Целл Атлас ће остварити три главне ствари. Прво, направиће супер тачну 3Д мапу места где у људском телу бораве различите врсте ћелија. Такође ће открити који су гени активни унутар сваке ћелије, помажући истраживачима да разумију како се ткива развијају и функционишу на генетском нивоу. И треће, истраживање ће вероватно открити нове врсте ткива.
До сада су истраживачи идентификовали око 300 различитих врста ћелија у људском телу, укључујући ствари попут масних ћелија и неурона. Али последњих година, нове молекуларне анализе откриле су типове који су истраживачи претходно пропустили, укључујући две нове врсте ћелија мрежнице и нову имунолошку ћелију која производи стероид који ствара супресију.
Вероватно ће Атлас открити много више нових типова ткива. "Видећемо неке ствари које очекујемо, ствари за које знамо да постоје, али сигуран сам да ће бити потпуно нових ствари", каже Мике Стуббингтон, са Сангер института у Великој Британији, који је главни сарадник на пројекту. „Мислим да ће бити изненађења.“
Крајњи циљ Атласа отвореног кода је убрзати открића медицинских истраживача и биолога широм света, који ће те информације користити за проучавање развоја ћелија и стварање нове ере прецизне медицине са високо циљаним лековима и третманима.
