Док се експедиција организовала на обалама реке Мисисипи у фебруару 1804. године, Вилијам Кларк је писао свом старијем брату Џонатану, коме се дошао ослонити на смернице и савете. Двадесет година старији од Вилијама, Јонатхан је био потпуковник у Револуционарном рату и британски ратни заробљеник од 1780. до 1781. Тек након Јонатханове условне слободе 1781, када се вратио кући да остану у рату, браћа су се добро упознала. Као најстарији Цларков рођак од десет година, Јонатхан је млађем мушкарцу постао нешто што је очева фигура. Заиста, када је Вилијам напустио Индијану у октобру 1803. године са новим откривеним корпусом, Џонатан је провео два дана с њим, путујући кобилицом низ реку Охио.
У овом писму, преузетом из Деар Бротхер, збирке писама Виллиама Цларка које је уредио Јамес Ј. Холмберг, Виллиам говори Јонатхану о догађајима који воде преласку Лоуисиана Территори-а из француске и шпанске власти на америчку власт, а који би се одржали у марту 9, 1804, у Ст. Лоуису. (Званична церемонија преноса земљишта, која је трајала 21 дан, одржана је у Нев Орлеансу крајем 1803.) Куповина Лоуисиане, наравно, променила је природу експедиције из прикривене потраге за северозападни пролаз у отворено извиђање трговинских места и будућа насеља.
Драги брате
Ст. Лоуис 25. Феби. 1804
Ваше писмо од првог јануара прихватио сам пост пре последњег и требало би да вам га напишем последње, али ја сам у то време био тако добар да нисам могао .... Капетан Левис и ја стигли смо у ово краће време пре тога, да бисмо [сиц] направили неопходне аранжмане за наш пут до Миссоуреиса, који ће наредно бити окрутно,
Поручник Говр. овог места одбацио је наредне недеље од своје владе да преда ову провансу капетану Стоддард ајунту Француске републике и Цомдта. да би Сједињене Државе примиле колони за Саидне државе .... сјајна вечера и поррада одржане су на поручнику Говрс. - јутрос је капетан Стоддард поднео захтев у име француске републике и сазвао одговор, поручник Говр. да би очекивао испоруку и поправио би време што је пре могуће .... вечерали смо као јуче са поручник Говр. најчастнија вечера и велика компија. био је приказан сјајни Деал формалности и параде_ Капетан С [тоддард] показао ми је све његове наредбе & ц. шта он намерава да изда, они су такви какве ја одобравам ....
Молим вас да ми искрено представите сестру Јохн Мр. & Госпођу Темпле и славу и верујте ми да поседујем више од братске представе Вм Цларк
